Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms