Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms