Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd4Q9QY39 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms