Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms