Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxe3Q9QY14 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms