Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyth1Q9QX11 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms