Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd2apQ9JLQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms