Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rfx5Q9JL61 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rfx5Q9JL61 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rfx5Q9JL61 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rfx5Q9JL61 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rfx5Q9JL61 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms