Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms