Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms