Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms