Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms