Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhojQ9ER71 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms