Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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