Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufa8Q9DCJ5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufa8Q9DCJ5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms