Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ift43Q9DA69 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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