Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms