Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc70Q9D9B0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms