Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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