Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms