Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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