Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ttc9bQ9D6E4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ttc9bQ9D6E4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9bQ9D6E4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9bQ9D6E4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9bQ9D6E4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ttc9bQ9D6E4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc9bQ9D6E4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc9bQ9D6E4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc9bQ9D6E4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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