Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms