Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms