Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc8bQ9D2D9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc8bQ9D2D9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms