Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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