Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Necap2Q9D1J1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Necap2Q9D1J1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms