Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms