Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpsap1Q9D0M1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms