Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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