Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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