Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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