Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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