Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms