Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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