Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms