Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms