Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ms4a4dQ99N05 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ms4a4dQ99N05 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ms4a4dQ99N05 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ms4a4dQ99N05 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ms4a4dQ99N05 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a4dQ99N05 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ms4a4dQ99N05 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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