Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Sh3bp5lQ99LH9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Sh3bp5lQ99LH9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Sh3bp5lQ99LH9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Sh3bp5lQ99LH9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Sh3bp5lQ99LH9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms