Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RtcbQ99LF4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RtcbQ99LF4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms