Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms