Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms