Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mcoln1Q99J21 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms