Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctu1Q99J10 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Ctu1Q99J10 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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