Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sfxn4Q925N1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sfxn4Q925N1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sfxn4Q925N1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms