Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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