Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms