Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim59Q922Y2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms