Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms