Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarca5Q91ZW3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarca5Q91ZW3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms